Právo a bezpečnost
Daňové dopady prodeje online businessu v ČR: Kompletní průvodce 2025

Daňové dopady prodeje online businessu v ČR: Kompletní průvodce 2025

Daňové důsledky prodeje online businessu závisí na formě podnikání (OSVČ vs. s.r.o.) a typu transakce (asset deal vs. share deal). Projděte si kompletní průvodce zdaněním včetně časového testu, osvobození a optimalizačních strategií.

Prodej online businessu může znamenat příjem v řádu milionů korun — a správné daňové plánování může ušetřit stovky tisíc na daních. V tomto článku projdeme všechny daňové aspekty prodeje e-shopu, SaaS aplikace nebo obsahového webu v České republice.

OSVČ vs. s.r.o. — zásadní rozdíl

Daňové dopady se dramaticky liší podle toho, zda podnikáte jako fyzická osoba (OSVČ) nebo prostřednictvím právnické osoby (s.r.o.).

Prodej jako OSVČ (asset deal)

Pokud provozujete e-shop jako OSVČ, prodáváte jednotlivá aktiva (doménu, zásoby, know-how). Příjem se zdaňuje jako příjem ze samostatné činnosti dle § 7 zákona o daních z příjmů:

  • Sazba daně: 15 % (do základu 1 582 812 Kč) / 23 % (nad tento základ)
  • Sociální pojištění: 29,2 % z vyměřovacího základu (50 % příjmů po odečtení výdajů)
  • Zdravotní pojištění: 13,5 % z vyměřovacího základu
  • Celková efektivní sazba:36–45 % z čistého zisku z prodeje

Příklad: Prodáte e-shop za 3 000 000 Kč, náklady 500 000 Kč. Zisk 2 500 000 Kč podléhá dani z příjmu + pojistnému. Celkem zaplatíte cca 900 000–1 125 000 Kč.

Prodej podílu v s.r.o. (share deal)

Pokud e-shop provozujete v rámci s.r.o., prodáváte obchodní podíl. Příjem se zdaňuje dle § 10 jako ostatní příjem:

  • Sazba daně: 15 % / 23 % (dle výše příjmu)
  • Pojištění: NEPLATÍ SE — příjem z prodeje podílu nepodléhá sociálnímu ani zdravotnímu pojištění
  • Výdaj: Nabývací cena podílu (vklad do ZK + příplatek)
  • Celková efektivní sazba: 15–23 %

Časový test — osvobození od daně

Zcela zásadní je § 4 odst. 1 písm. s) ZDP:

Osvobození: Příjem z úplatného převodu podílu v obchodní korporaci je osvobozen od daně, pokud doba mezi nabytím a převodem přesahuje 5 let.

To znamená: Pokud jste s.r.o. založili (nebo podíl koupili) před více než 5 lety, neplatíte žádnou daň z prodeje podílu!

Praktický příklad

ParametrOSVČ (asset deal)s.r.o. do 5 lets.r.o. nad 5 let
Prodejní cena5 000 000 Kč5 000 000 Kč5 000 000 Kč
Nákladová cena1 000 000 Kč200 000 Kč (ZK)200 000 Kč (ZK)
Základ daně4 000 000 Kč4 800 000 Kč
Daň z příjmu~776 000 Kč~880 000 Kč0 Kč
Pojistné~570 000 Kč0 Kč0 Kč
Celkem odvody~1 346 000 Kč~880 000 Kč0 Kč

Rozdíl je propastný. Proto většina poradců doporučuje převést podnikání do s.r.o. minimálně 5 let před plánovaným prodejem.

Asset deal vs. share deal — daňové srovnání

Asset deal (prodej aktiv)

  • Prodáváte konkrétní aktiva (doménu, sklady, smlouvy)
  • Kupující získává čistá aktiva bez historických závazků
  • Možnost odpisu goodwillu u kupujícího
  • Složitější administrativně (převod každého aktiva zvlášť)
  • U s.r.o. — zisk z prodeje je příjmem firmy, zdaněn 21 % DPPO + dividenda 15 %

Share deal (prodej podílu)

  • Prodáváte obchodní podíl v s.r.o.
  • Firma přechází kompletně včetně historie
  • Časový test 5 let = osvobození od daně
  • Jednodušší provedení (změna v OR)
  • Riziko skrytých závazků pro kupujícího

DPH při prodeji online businessu

DPH aspekty závisí na typu převáděných aktiv:

  • Prodej podílu v s.r.o. — osvobozeno od DPH bez nároku na odpočet (§ 54 ZDPH)
  • Prodej domény — elektronická služba, podléhá DPH 21 %
  • Prodej skladu — standardní zdanitelné plnění, DPH dle typu zboží
  • Prodej software — elektronická služba, DPH 21 %
  • Převod podniku (závodu) — dle § 13 odst. 8 ZDPH se za dodání zboží ani poskytnutí služby nepovažuje

Optimalizační strategie

  1. Převod OSVČ → s.r.o. — pokud plánujete prodej za 5+ let, převeďte podnikání do s.r.o.
  2. Vklad do s.r.o. — vložte e-shop jako nepeněžitý vklad, nabývací cena podílu = hodnota vkladu
  3. Holdingová struktura — pro transakce nad 10 mil. Kč zvažte holding (osvobození dividendové srážkové daně)
  4. Rozložení platby — earn-out může rozložit příjem do více zdaňovacích období
  5. Odborné poradenství — investujte do daňového poradce, úspora na daních násobně převýší honorář

Oznamovací povinnosti

Pokud příjem z prodeje přesáhne 5 000 000 Kč, musíte podat oznámení o osvobozených příjmech dle § 38v ZDP. Pokuta za nesplnění může dosáhnout 15 % z neoznámeného příjmu.

⚠️ Upozornění: Tento článek má informativní charakter a nenahrazuje odborné daňové poradenství. Daňové zákony se mění a každá situace je individuální. Vždy konzultujte s certifikovaným daňovým poradcem.
💡 Tip od Exituj.cz: Při prodeji přes naši platformu vás spojíme s daňovými poradci, kteří se specializují na prodeje online businessů. Zaregistrujte se a nechte si poradit.
Martin Černý
O autorovi

Martin Černý

SEO specialista a digitální stratég

Martin se 9 let věnuje SEO a digitálnímu marketingu. Vedl marketingové oddělení dvou úspěšných SaaS startupů, než se začal specializovat na valuaci digitálních aktiv. Pomáhá prodejcům maximalizovat hodnotu webu před prodejem optimalizací traffic a konverzí.

SEO digitální marketing SaaS traffic analýza

💼 Prodáváte web nebo firmu?

Exituj.cz nabízí kompletní nástroje pro prodej webů a malých firem — jednoduchý inzerát, Data Room pro dokumenty a Q&A modul pro komunikaci s kupujícími.

Registrovat se zdarma Prohlédnout nabídky